ComparePSD é uma ferramenta gratuita para Windows que compara camada por camada, dois arquivos PSD.
Incluindo os efeitos na comparação, é ideal para os que trabalham com uma grande quantidade de arquivos e não criaram um controle de versões efetivo.
Ainda que não seja web, nem funcione para todos os sistemas operacionais, acredito que pode ajudar muito a quem trabalha na área.